此病的病因目前尚不清楚。根据研究，有以下几种可能：
(1)遗传因素：本病有地区性发病倾向，即某些地区发病较多。对表明人类遗传特征的物质HLA的研究发现，在白塞病高发病区，病人HLA — B5及HLA－B51的阳性率比正常人高6倍。因此，有人提出，这两种HLA类型所代表的遗传特征可能是白塞病发病的内环境。但是，白塞病病人并非每例均有HLA — B5或HLA — B51阳性。所以，遗传因素还不能肯定为病因。
(2)感染因素：即细菌或病毒侵犯人体引起发病。国内学者发现，本病病人中，有三分之 — 人过去患过结核病或者正在患结核病，而且部分病人经过治疗结核病后，不仅结核治愈，而且白塞病症状也有好转。近年，人们又发现单纯疱疹病毒和溶血性链球菌也与本病有关，但尚未肯定为本病病因。
(3)免疫失调：医学家们在许多病变部位，如血管周围、脑脊液和血管壁等病损处可以见到与免疫反应有关的淋巴细胞及免疫球蛋白、补体出现；病人血中有自身抗体，如抗口腔粘膜抗体、抗动脉壁抗体等和血中免疫球蛋白升高，淋巴细胞的正常比例消失等等。因此，提示免疫失调在本病发病中占有重要地位。
(4)微量元素：病人病变组织多种微量元素含量增高，如有机氯、有机磷和铜离子。有人发现某些微量元素如锌、硒缺乏与白塞病有关。
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相关链接：中华中医疑难研究院红斑狼疮研究所所长、北京安定门中医医院中医免疫科主任张东明研究员、协和名医张德景教授,与新疆红斑狼疮研究所的全体研究员、专家教授在国家卫生、科技部门的大力支持下，历经四十余年，吸取祖国医学之精华，运用中医辩证论治、阴阳平衡的理论，经过反复论证，不断的推敲，总结三万多例红斑狼疮患者的治疗经验，筛选出对红斑狼疮具有“攻补兼施” （既能清热凉血、解毒散瘀，又能扶正固本，益气养阴）双向作用的药物，通过现代科学提取有效成份浓缩精制而成。通过长期动物试验及国家卫生部指定在上海医科大学、北京医科大学、广州中山医科大学等数十家国家级新药临床基地实验表明，证实所用疗法疗效确切而无毒副作用，最大的特点是避免了免疫抑制剂对病人引起的不可逆转的脏器损害，在不用糖皮质激素的情况下，能有效的控制病情和消除病症。
通过中华中医疑难病研究院红斑狼疮研究所研究实践证明：红斑狼疮只是一种慢性疾病，并不是不治之症，只要及时采取有效措施，将病情控制在正常的范围之内，患者就可以象正常人一样生活。我们在此有必要提醒患者及家属不要病急乱投医，走了冤枉路，花了冤枉钱，导致用药不当，最后病情失控，使患者雪上加霜。通过我们积极正确的治疗，有一部份患者可以基本治愈，一部份患者是可以控制的，极为严重的少部份患者也能改善症状、减轻痛苦、提高生存质量。
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